从20世纪80年代借用原糖烟酒公司仓库到90年代购置自己的仓库，再到今天自建的大型现代化烟草物流中心，深圳烟草物流中心依靠科技进步和技术创新，不断推动由传统商业向现代流通转变，取得了累累硕果。
开发卷烟商业供应链配送系统。为适应现代卷烟物流建设的需要，探索“电话访销、网上配货、电子结算、现代物流”的卷烟销售模式，深圳烟草与专业机构共同开发了卷烟商业供应链配送系统。该系统的成功开发与运行使深圳烟草实现了统一采购、统一仓储、统一分拣、统一送货、统一价格和集中电话订货的“五统一、一集中”的卷烟销售网络模式。
不断改进条烟分拣线。深圳烟草物流中心第一代条烟分拣线为塔式结构，单线每小时分拣能力为2000条左右。随着散条卷烟分拣量的不断增加，第一代条烟分拣线逐渐不能适应形势的发展。为大幅度提高条烟分拣效率，缩短分拣作业时间，物流中心与有关单位联合开发了新一代立式条烟分拣线。经过试用，立式条烟分拣线设计科学、系统稳定，分拣效率比第一代条烟分拣线提高了300%，达到了每小时8000条。2006年，物流中心对 原有的条烟分拣线进行了技术改造，安装了4条新的立式条烟分拣线，使得分拣效率由以前的每小时1万条提高到了每小时3.2万条。
成功研制塑料可折叠周转箱。在卷烟分拣与配送中，包装散条卷烟是必不可少的工作，也是成本控制的一个重要环节。深圳烟草物流中心从绿色环保和节约成本的角度出发，联合专业公司研制了塑料可折叠周转箱。箱子用塑料做成，打开后能容纳25条卷烟，折叠起来却不足8厘米厚，而且每个箱子上下两端各有凹槽和凸棱，一个箱子上端的凹槽和另一个箱子下端的凸棱正好吻合，十几个箱子摞在一起都不会倒。根据实际使用的情况，物流中心目前使用的周转箱使用寿命超过3年（使用次数600次），大大降低了包装成本，并且实现了整个卷烟配送过程零污染。周转箱绿色环保、灵活耐用和成本低廉的特性得到国家局和其他省市兄弟单位的认可，目前已经在许多地区推广使用。
